1990

En 1991, de la mano del técnico Llorenç Serra Ferrer, tral eliminar a equipos como Valencia y Sporting de Gijón, disputaron por primera vez, la final de la Copa del Rey ante el Atlético de Madrid con quienes cayeron en la prórroga, por 1-0, gol de Alfredo Santaelena. La alineación en ese histórico día fue la siguiente: Ezaki Badou, Serer, Del Campo, Fradera, Armando, Sala, Pedraza, Marcos, "Chichi" Soler, Nadal y Hassan Nadder. Entraron desde el banquillo Álvaro Cervera y Claudio.
En la temporada 1991/1992 el equipo descendió de nuevo a la Segunda División Española. Vivió entonces su lustro más negro en esta década formando equipos que siempre se situaron un peldaño más abajo de lo que mostraban a priori y confirmando lo difícil que es salir del pozo de la Segunda División. De los cinco años, dos quedó fuera de los puestos de ascenso directo y promoción (1994 y 1995) y otros dos jugó promociones sin suerte contra equipos de Primera División de entonces (como el Albacete en 1993 y Rayo Vallecano en 1996). En esos años brillaron jugadores como Juan Sánchez, Toni Prats o los balcánicos Vlada Stosic y Milojevic. Ambos fueron fichados por equipos de Primera (Betis y Celta respectivamente).